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Beratung,  Projektmanagement  &  Training  

im Bereich  Proteinanalytik  &  Proteomics


Beratungsleistungen

Proteome Consult bietet Markt- und Projektmanagementerfahrung sowie wissenschaftliche Beratung für Firmen und Institute die sich im Bereich Proteinanalytik & Proteomics engagieren.

Wir helfen Ihnen bei der Planung Ihrer Projekte, benennen geeignete Methoden, optimieren Arbeitsanweisungen und erstellen Zeit- und Kostenpläne. Wir finden für Ihr Projekt geeignete Partner im industriellen oder akademischen Bereich und koordinieren die Projektvorbereitung bis zur Formulierung eines ausführbaren, in einen Kooperationsvertrag eingebundenen Projektplans.

Für Firmen und Institute die proteinanalytische Aufgaben an Dienstleister vergeben, bieten wir die Übernahme des Projekt- managements vom Projektdesign bis zum Report.

Für Firmen und Institute die im Bereich Proteinanalytik engagiert sind, stellen wir unsere Expertise bei der Einrichtung von Laboratorien sowie bei der Optimierung experimenteller Abläufe vor Ort zur Verfügung.



Datenanalyse & Softwareentwicklung

Proteome Consult bieten Ihnen qualitativ hochwertigen 2D-Gelbildanalyse-Service mit der Erfahrung Matchsets mehrerer hundert hochauflösender 2D-Gelen (> 5000 Proteinspots) in einer einzigen gematchten, annotierbaren Proteomdatenbank zusammenzuführen. Statistisch signifikante Expressionsunterschiede können bestimmt und die interessantesten Spots zur Proteinidentifizierung oder Sequenzierung ausgewählt werden.

Im Bereich Proteinidentifizierung und Proteinsequenzierung können aus Messdaten (Maldi-MS-Fingerprint, MS/MS-Spektren, Edmann-Sequenzierungsdaten) Proteinidentifizierungen und Proteinsequenzen ausgewertet werden.

Wir erstellen Reports, fertigen Gutachten und entwickeln Skripte & Makros zur Datenkonversion, Messdatenauswertung und Präsentation, bitte fragen Sie nach!


Projekte

Proteome Consult plant proteinanalytische Projekte und führt diese in Kooperation mit Industriepartnern und öffentlichen Forschungseinrichtungen im Sinne der Vorgaben unserer Kunden durch.

Wir halten engen Kontakt zu den ausführenden Firmen, greifen wenn erforderlich korrigierend und unterstützend ein, bewerten und interpretieren Ergebnisse projektübergreifend im Sinne der vom Kunden spezifizierten Projektziele.

Unser Projektmanagement zielt darauf, Ihnen Ergebnisse auf dem neuesten Stand der Technik zu liefern. Unsere Partnering-Strategie erlaubt es uns, hierbei auf unterschiedliche Technologieplattformen zurückzugreifen und unsere Lösungen entsprechend den Bedürfnissen unserer Kunden anzupassen.



New Service


  Bioinformatische Dienstleistungen

In Ergänzung der etablierten 2D-Gelauswertung-Methoden Melanie/ImageMaster (GeneBio) und Redfin (Ludesi) bietet Proteome Consult jetzt auch Delta2D 4.X (Decodon) basierte 2D-Gelauswertung auf 64bit-Windows Plattformen an.

Proteome Consult hat Skripte zur Extraktion taxa-sortierter Datenbanken im FASTA-format aus der NCBInr Proteindatenbank entwickelt. Taxa-sortierte Datenbanken erlauben erheblich kürzere Suchzeiten während der Mascotsuche. Geschwindigkeitssteigerungen um mehr als das 10-fache werden bei kleinen Datenbanken auf älterer Hardware erzielt. Bei aktueller Hardware können noch immer Geschwindigkeitssteigerungen von etwa dreifach erzielt werden. Taxa-sortierte Datenbank für Mensch, Maus und Ratte stehen für Testzwecke zur Verfügung.


Training

Proteome Consult hat sämtliche eigenen Trainingsaktivitäten beendet. Wir bieten allen akademischen und industriellen Anbietern die Möglichkeit fachspezifische Trainingskurse auf Proteome Consults Webseite zu annoncieren.